焉耆县人民医院始建于1952年12月，是一所集医疗、教学、预防保健、好转、急救、社区卫生服务为一体的综合性二级删除医院，系河北医科大学第二、第三附属医院、新疆医科大学附属医院、自治区人民医院技术协作医院，四川大学华西医院、新疆医科大学附属医院、自治区人民医院远程会诊教学定点医院，新疆医科大学、甘肃平凉医专、巴州卫校教学实习医院。
医院占地总面积37000平方米，其中业务用房面积22000平方米。编制床位299张，开放床位400张。设有临床科室10个：内分泌、神经治疗科，呼吸消化治疗科，心血管肾病治疗科，普外科，骨关节外科，脑外科，妇产科，儿科，眼耳鼻喉科，中医皮肤肛肠科；亚临床科室5个：重症监护室、急诊科、手麻科、口腔科、美容科；医技、功能科室8个：放射科、CT室、检验科、病理科、功能科、身体检查中心、药械科、理疗科；职能、总务后勤服务科室20个：供应室、洗衣房、护理外勤部、门诊输液室、四十里城子镇卫生院、行办、医教部、护理部、人力资源部、社会服务部、财务部、运营采购部、院感科、信息部、物业保卫部、水电暖绿化部、司机班、膳食部及两个社区卫生服务站。
医院先后获得自治区级文明单位、卫生红旗单位、无烟先进单位、自治州级五佳医院、医院管理先进单位、花园式单位、继续医学教育先进单位、助残先进单位、自治州文化卫生发展年先进集体、自治州级模范职工之家、自治州卫生系统医院管理工作先进单位、安康杯技能竞赛先进单位、自治县行风评议单位、社会治安综合治理先进单位等荣誉称号！
焉耆县医院医疗美容科成立于1997年，现有美容师3名，医师1名，先后到北京美容中心进修美容外科，相继开展了重睑术、隆鼻术、眼袋切除术、酒窝成形术、吸脂术、三纹、三绣、除皱、切眉术。来诊人员除本县周边团场外，因价格合理，适合本地区消费情况，吸引了部分市区人员前来就诊。
