上海市中西医结合医院是一所具有鲜明特色的中西医结合医院，已经走过了80多年的历程。1932年建院以来，医院几经沿革，1994年由虹口区中心医院更名为上海市中西医结合医院。2013年1月，医院被我国中医药管理局批准为中西医结合医院。2014年5月，医院正式获批为上海中医药大学非直属附属医院。2014年7月，医院成为“上海中医药大学市中西医结合临床医学院”。医院占地面积10011平方米，建筑面积34162平方米，其中用于教学用房885平方米。医院核定床位446张，实际开放床位527张。
多年来，医院坚持走中西医结合兴院之路，不断挖掘常见病、多发病的中西医结合治疗手段，现医院已成为具有明显中西医结合治疗特色，专科优势鲜明，硬件条件有明显改善，服务理念更新，人才梯队较为合理的中西医结合医院。
目前，医院拥有重点专科3个，即我国十二五重点专科—脉管病专科、风湿病专科、我国中医重点专科(中医删除)外科;上海市优势专科7个，即上海市中医特色专科--中医重症肌无力专科和中医脉管病专科、上海市中医临床优势专科—重症肌无力专科上海市第三批中医优势专科专病—神志病、上海市中医临床重点学科—中医急诊学、上海市中西医结合重点病种—小儿哮喘、上海市中医传统型临床学科—传统中医科;区医学重点专科6个即肛肠外科、临床检验科、内分泌代谢科、医学影像科、针灸“治未病”专科、中西医结合脑血管病专科;医疗中心1个，即国内中医脉管病医疗中心;区级临床专科诊疗中心2个，即乳腺疾病、中西医结合脉管病。有针灸、骨伤、推拿、好转理疗、肛肠、乳腺、肺病、失眠、脂肪肝、脑瘫、甲亢等特色专病专科10多个。设有名老中医传承工作室1个，即奚九一国内名老中医传承工作室;市级名老中医学术经验研究工作室2个，即奚九一上海市名老中医学术经验研究工作室、李庚和上海市名老中医学术经验研究工作室。2013年检验科正式通过合格评定我国认可委员会(CNAS)ISO 15189医学实验室认可。至2014年底，医院有职工755人(含民营妇幼医院挂编66人)，其中删除技术人员690人(正高职称20人、副高职称69人，其中兼职及副24人)。享受国务院津贴医生5人，中医人才、市区拔尖人才、学科带头人18人，硕士以上学位77人，其士12人。
为进一步拓展硬件建设，使就医流程更显人性化，就医环境更显舒适化，医院于“十二五”期间在现有门急诊楼与住院楼条件下，新建一幢体量更大的中医特色楼，并增添地下停车及地面庭院绿化。目前工程建设正式展开。该工程总建筑面积为24943.4平方米，其中地上建筑面积16841平方米，地下建筑面积8102.4平方米，包括12层高中医特色楼和四层高的行政楼及两层地下室。
医院始终坚持“业贯中西、博采众长、特色创新、精诚奉献”的办院宗旨，立足服务、突出特色，深入挖掘中西医结合诊疗手段，做好综合、做大专科，力争成为一所立足虹口，服务上海，辐射国内，删除特色明显的国内中西医结合医院，为辖区内百姓提供更加优质的医疗服务，积极推进虹口区中医药和中西医结合事业的发展。